特別喜歡這種運用 AI 突破人類認知極限的黑科技,這次的目標是人類 DNA
Google DeepMind 發布新模型 AlphaGenome Atlas,一個包含人類 DNA 中 90 億個單核苷酸變異影響預測的平台。
作為一個生物科技門外漢,我的第一個直覺是 DNA 的組合只有 90 億種?數字感覺也太小了。原來因為模型限縮單核苷酸變異(因為看不懂所以第一次看我直接忽略 😂)的可能性,所以才只有這個數字。若要把所有形式的基因變異的可能性全部算出,那個數字會是天文數字。
單核苷酸變異指的是「在一串 DNA 序列中,正常編碼與變異編碼只有一個核苷酸差異」。例如正常人體製造血紅素的基因編碼是 G A G,而變異後的基因變成 G T G,其中 A 變成了 T,這就是單核苷酸變異。這個變異的結果會導致蛋白質形狀改變,形成鐮刀型貧血症。
AI 就是透過大規模的運算,將這 90 億種變異以及可能的後果全部預先算出來。經過與已知變異後果比對、濕實驗室驗證、數萬名真實人類的全基因體資料對照等方法,最終確保 AlphaGenome Atlas 預測的可信度。
有了這個工具後,未來研究人員、醫生可以透過快速鎖定變異目標,極大幅度減少實驗時間。目前模型免費提供非商業用途存取,並將於近期在 Google Cloud 上提供商業用途。